就读阜阳科学技术学校的学费标准严格按照国家和安徽省相关规定执行，属于中等职业教育收费范畴，总体费用并不高昂。对于广大农村（含县镇）学生、城市涉农专业学生和家庭经济困难学生，国家实行免学费政策，覆盖了绝大部分在校生。
在资助政策方面，体系较为完善。首先，国家助学金用于资助家庭经济困难的学生，资助标准根据困难等级分档发放，覆盖范围较广。其次，属于原建档立卡贫困户家庭的学生，可以享受免学费和国家助学金政策，同时还可申请相关的扶贫补助。再次，学习成绩优秀、技能表现突出的学生，有机会获得国家奖学金、学校设立的奖学金以及企业提供的专项奖学金。此外，学校还通过提供校内勤工助学岗位等方式，帮助家庭经济困难学生减轻生活负担，顺利完成学业。
