就读云南交通技师学校的学费标准严格遵循国家和云南省对中等职业教育的相关规定，总体费用相较于普通高中和民办院校更为经济。学校属于公办职业学校，学费本身并不高昂。
更重要的是，学生可以享受一系列国家资助政策，极大减轻家庭经济负担。首先，对全日制正式学籍一、二、三年级所有农村（含县镇）学生、城市涉农专业学生和家庭经济困难学生（城市家庭经济困难学生比例按在校城市学生的15%确定）免除学费。这是一项覆盖面极广的普惠政策。
其次，国家助学金政策资助全日制正式学籍一、二年级涉农专业学生和非涉农专业家庭经济困难学生（按非涉农专业在校生的20%确定），资助标准每生每年2000元，主要用于生活费补助。此外，属于“直过民族”或建档立卡贫困户等特殊困难家庭的学生，还可享受额外的生活补助等政策。学校自身也可能设立校内奖学金、助学金或提供勤工助学岗位，对品学兼优或家庭困难的学生进行奖励和帮扶。学生在入学时，学校会进行详细的政策宣讲和申请指导。
