亳州工业学校紧密结合区域经济发展需求，重点建设了一批特色鲜明、实力突出的王牌专业。其中，数控技术应用专业是学校的重点建设专业之一，该专业配备有先进的数控实训设备，注重学生实践操作能力的培养，旨在为现代制造业输送紧缺的技术技能人才。汽车运用与维修专业也是学校的强势专业，拥有完善的汽车实训中心，涵盖汽车机电维修、车身修复、汽车售后服务等多个方向，对接快速发展的汽车后市场产业。
此外，计算机应用专业作为传统优势专业，紧跟信息技术发展潮流，在软件与信息服务、网络技术、数字媒体技术应用等方面均有扎实的教学基础。电子商务专业则依托亳州丰富的商贸物流和中药材产业资源，培养学生网络营销、网店运营、客户服务等实战技能，与地方经济特色高度融合。这些专业均建有相应的校内外实训基地，课程设置贴近岗位实际，形成了较强的专业竞争力。
