广东惠州农业学校作为一所公办国家级重点中等职业学校，其专业设置紧密对接区域产业发展需求，形成了以现代农业为核心，多学科协调发展的专业体系。学校的王牌专业主要集中在现代农业技术、畜牧兽医、园林技术等领域。其中，现代农业技术专业是学校的传统优势专业，注重智慧农业、设施农业等现代农业技术的教学与实践，培养学生掌握作物生产、农业经营与管理等核心技能。
畜牧兽医专业也是学校的重点建设专业，配备有现代化的动物诊疗、养殖实训室，课程涵盖动物解剖生理、疾病防治、宠物护理等，毕业生在养殖企业、宠物医院等领域非常受欢迎。园林技术专业则侧重于园林规划设计、植物栽培与养护、景观工程施工等技能的培养，契合城乡绿化与美丽乡村建设的需求。此外，学校的电子商务、会计事务等专业也因贴合市场需求，实践性强而成为热门选择。
