四川省甘孜卫生学校结合民族地区医疗卫生人才需求，重点建设了一批特色鲜明、就业稳定的王牌专业。其中，护理专业是学校的传统优势与核心专业，该专业培养具备现代护理理念和熟练护理操作技能的人才，课程设置紧密对接临床实践，毕业生在各级医疗机构尤其是基层医院深受欢迎。
医学检验技术专业也是学校的重点专业之一，该专业培养学生掌握医学检验的基本理论和技能，能够从事临床检验、卫生检验等工作。随着医疗诊断需求的增长，该专业毕业生拥有良好的就业前景。此外，康复技术专业近年来发展迅速，针对社会对康复治疗人才日益增长的需求，培养学生掌握物理治疗、作业治疗等康复技能，成为服务慢性病患者、老年人和残疾人的专业力量。
药剂专业同样颇具实力，主要培养能从事药品调剂、制剂、销售及管理的中初级专业人才。这些专业均紧密围绕甘孜州及周边地区基层卫生服务的实际需要设置，实践性强，是学校长期保持高就业率的重要支撑。
