北京交通运输职业学院中专部严格执行北京市中等职业学校学费收费标准，学费水平属于公办中职学校的正常范围，相较于许多民办院校，学费并不昂贵，性价比较高。对于家庭经济困难的学生，国家和学校层面建立了完善的资助体系，确保学生不因经济原因辍学。
主要的减免和资助政策包括：所有农村（含县镇）户籍学生、城市涉农专业学生及家庭经济困难城市户籍学生，可享受免学费政策。家庭经济困难的学生还可申请国家助学金，根据困难等级享受不同档次的资助。此外，学习成绩优异、技能表现突出的学生可以申请国家奖学金、学校奖学金以及企业设立的专项奖学金。学校还会提供勤工助学岗位，帮助学生通过劳动获得一定报酬。在入学时，学校会开通“绿色通道”，确保家庭经济困难新生能顺利办理入学手续。
