就读云南文山农业学校的学费并不昂贵，且国家及学校层面提供了完善的减免和资助政策，旨在减轻学生家庭经济负担，确保学生不因贫困而失学。根据国家关于中等职业教育的普惠政策，对全日制正式学籍一、二、三年级在校生中所有农村（含县镇）学生、城市涉农专业学生和家庭经济困难学生免除学费（艺术类相关表演专业除外）。这意味着绝大部分学生都能享受学费减免。
在资助政策方面，首先是国家助学金。全日制正式学籍一、二年级在校涉农专业学生和非涉农专业家庭经济困难学生，可以申请国家助学金，资助标准每生每年平均为2000元，具体金额根据困难等级分档评定。这为家庭经济困难的学生提供了基本的生活保障。
其次是国家奖学金。用于奖励中等职业学校全日制在校生中特别优秀的学生，奖励标准为每生每年6000元，这是对品学兼优学生的极大鼓励。此外，学校还可能设立校内奖学金、助学金，或提供勤工俭学岗位。对于来自云南省部分特定地区的农村学生，还可能享受生活补贴等地方性资助。对于建档立卡贫困家庭学生，更有相应的精准资助政策确保其顺利完成学业。学生在入学时，学校会进行详细的政策宣讲和申请指导。
