重庆市医药科技学校作为一所公办中等职业学校，其学费标准严格按照国家及重庆市的相关规定执行，相较于许多民办院校和普通高中，学费总体处于较低水平，性价比较高，能够减轻学生家庭的经济负担。
在减免和资助政策方面，学校全面贯彻落实国家职业教育资助政策。首先，对所有全日制正式学籍的一、二、三年级在校学生免除学费（艺术类相关表演专业除外）。其次，国家助学金政策覆盖全日制正式学籍的一、二年级家庭经济困难学生，以及连片特困地区农村学生（不论家庭经济是否困难），资助标准根据困难等级分档发放。此外，品学兼优的学生还有机会获得国家奖学金、学校奖学金等奖励。对于家庭特别困难的学生，学校还可能提供勤工助学岗位、特殊困难补助等帮扶措施，确保学生不因经济原因而辍学。
