云南中医药中等专业学校作为一所公办中等职业学校，其学费标准严格按照国家及云南省的相关规定执行，相对于许多民办院校和普通高中，学费通常较为适中，旨在让更多学生能够接受职业教育。
在减免和资助政策方面，学校全面贯彻落实国家的中职教育资助政策。所有在校生中，农村（含县镇）户籍学生、城市家庭经济困难学生等可以享受免学费政策。此外，国家助学金覆盖范围包括连片特困地区农村学生、其他家庭经济困难学生等，资助标准每生每年不等。品学兼优的学生还有机会获得国家级、省级或校级的奖学金。对于家庭特别困难的学生，学校还可能提供勤工助学岗位或临时困难补助。具体政策细节和申请条件，学生及家长可在入学时详细咨询学校学生资助管理部门。
