在云南中医药中等专业学校就读的学生，完全有机会申请并获得各类奖学金。奖学金体系是学校激励学生勤奋学习、全面发展的重要举措。奖学金的设立通常包括多个层次和类别。
最高级别的是国家奖学金，用于奖励特别优秀的中等职业学校全日制在校生，奖励标准高，但名额较少，竞争激烈。其次是云南省政府奖学金，用于奖励品学兼优的学生。此外，学校自身也会设立校级奖学金或企业冠名奖学金，奖励在学业成绩、技能竞赛、品德表现等方面突出的学生。申请奖学金一般需要满足一定的条件，如学业成绩排名靠前、操行评定优良、无违纪记录等。学校会公开发布评选通知，符合条件的学生可按程序提交申请，经过班级、系部及学校评审后确定获奖名单。获得奖学金是对学生努力的肯定，也能在经济上给予支持。
