在上海市医药学校就读，学生完全有机会申请并获得多种奖学金。学校构建了由国家、上海市、学校及社会力量共同参与的奖学金体系，旨在激励学生勤奋学习、积极进取、全面发展。
国家级奖学金方面，成绩特别优秀、技能表现突出的学生可以申请国家奖学金，这是面向中职学生的最高荣誉之一，奖励标准高，旨在树立优秀学生典范。此外，对于品学兼优的家庭经济困难学生，还有国家励志奖学金的评选机会。
上海市政府和市教育主管部门设立了市级奖学金，如上海市奖学金等，用于奖励在德、智、体、美、劳等方面全面发展，或在专业技能、科技创新、文体活动等某一方面有突出表现的学生。这些奖学金评选覆盖面较广，激励效果明显。
学校层面设有校级奖学金，包括综合奖学金和单项奖学金。综合奖学金根据学生学年综合测评成绩评定，分为不同等级。单项奖学金则用于奖励在专业技能大赛、文明风采、社会实践、志愿服务、文体竞赛等方面取得优异成绩的学生。校级奖学金旨在鼓励学生个性化、多元化发展。
许多与学校合作的企业和社会团体也在学校设立了专项奖学金或企业冠名奖学金，如“上药奖学金”、“国控奖学金”、“华氏奖学金”等。这些奖学金通常由合作企业出资设立，不仅提供资金奖励，还往往包含企业参观、实习优先等机会，紧密连接学业与未来职业。学校奖学金评选过程公开、公平、公正，有明确的评选办法和程序，鼓励符合条件的学生积极申报。
