就读玉溪卫生学校的学费标准严格遵循云南省物价部门和教育部门对公办中等职业学校的规定，相较于许多民办院校和普通高中，其学费处于较低水平，对于大多数家庭而言是可以承受的。
在减免和资助政策方面，国家及地方政府提供了多项支持。首先，所有全日制正式学籍一、二、三年级在校生中，所有农村（含县镇）学生、城市涉农专业学生和家庭经济困难学生（按城市学生比例核定）免除学费。其次，国家助学金覆盖全日制正式学籍一、二年级在校涉农专业学生和非涉农专业家庭经济困难学生，资助标准根据政策调整。此外，云南省对考入中职学校的建档立卡贫困家庭学生，还给予额外的生活补助。学校自身也可能设立奖学金、困难补助，并提供勤工助学岗位，构建了较为完善的“奖、助、免、补、勤”多位一体的学生资助体系，确保学生不因家庭经济困难而失学。
