就读福建第二轻工业学校的学费标准严格按照福建省物价部门核定的公办中等职业学校收费标准执行，相较于普通高中和民办院校，学费并不昂贵，且享受多项国家资助政策，总体费用负担较轻。
学校执行国家关于中等职业教育的免学费政策，对全日制正式学籍的一、二、三年级在校生免除学费（具体执行细则以当年政策为准）。除了免学费，还有完善的资助体系：国家助学金用于资助全日制正式学籍一、二年级家庭经济困难的学生，资助标准每生每年约2000元。此外，对于品学兼优的学生，可以申请国家奖学金和学校设立的各类奖学金。学校还可能提供勤工助学岗位，帮助家庭困难的学生通过劳动获得一定报酬。对于原建档立卡贫困户子女、低保家庭学生等特殊困难群体，还有相应的生活补助等更多帮扶。学生入学时，学校会进行详细的政策宣讲和申请指导。
