在玉溪农业学校就读，学生有多种机会申请奖学金，以表彰优秀、激励进取。最高级别的是中等职业教育国家奖学金，由国家设立，用于奖励特别优秀的中等职业学校全日制在校生，奖励标准为每生每年6000元，颁发国家统一印制的荣誉证书。申请者需满足学习成绩、专业技能、道德品质等多方面的严格条件。
其次，学校设有校级奖学金，每学期或每学年评选一次，主要根据学生的学业成绩、综合表现等进行评定，旨在奖励勤奋学习、全面发展的学生。此外，许多校企合作的企业也会在相关专业设立“企业奖学金”或“冠名奖学金”，奖励在专业技能学习或实习中表现突出的学生。
除了面向学业优秀的奖学金，学校还对在各级职业技能大赛、文体活动、精神文明建设等方面取得突出成绩的学生给予专项奖励。这些奖学金政策的设立，构建了完善的激励体系，不仅是对学生努力的认可，也能在经济上给予支持，极大地激发了学生的学习热情和争先创优的积极性。
