就读南宁电子工程学校的学费标准严格遵循广西壮族自治区物价部门和教育部门对中等职业学校的相关规定。相较于普通高中和高等院校，中职学校的学费普遍不高，且享受国家大力资助。对于广大农村（含县镇）户籍学生、城市涉农专业学生以及家庭经济困难学生，国家实行免学费政策，覆盖了绝大部分在校生。
除了免学费政策，国家还设立了中等职业教育国家助学金，用于资助家庭经济困难的学生，资助标准每生每年约2000元，主要覆盖涉农专业学生、集中连片特困地区农村学生以及其他家庭经济困难学生。此外，广西地方政府、学校自身以及社会力量也可能设立各类助学项目。对于品学兼优的学生，还有机会获得国家奖学金或学校设立的奖学金。对于家庭经济特别困难的学生，学校还会提供勤工俭学岗位，帮助学生通过劳动获得一定报酬，缓解经济压力。总体来说，国家构建了完善的“免、助、奖、勤”多位一体的中职学生资助体系，确保学生不因家庭经济困难而失学。
