核工业四零四工业学校在专业设置上并非只面向男生，同样开设了许多适合女生学习且具有良好发展前景的专业。辐射防护与核安全专业便是一个重要方向。该专业侧重于辐射监测、环境影响评价、安全防护管理等领域，需要从业者具备细心、严谨、负责的特质。毕业生可在核设施、医院放疗科、环保监测部门、海关检验检疫等单位从事技术与管理工作，工作环境相对较好，专业壁垒高。
工业分析与检验专业是另一个适合女生的选择。该专业培养掌握现代分析检测技术、实验室管理、质量控制等技能的人才。学生需要学习化学分析、仪器分析、样品处理等课程，实践性强。毕业后可在化工、制药、食品、环保等行业的质检中心或研发实验室工作，岗位稳定，对操作的规范性和准确性要求高，与女生的性格特点较为契合。
此外，随着学校专业体系的完善，也可能开设或与高职衔接诸如电子商务、会计、计算机应用等现代服务类专业。这些专业文理兼收，注重培养学生的信息技术应用能力、沟通协调能力和服务意识，就业面广泛，在各类企事业单位都有相应岗位，同样为女生提供了多元化的职业发展路径。
