北京自动化工程学校为学生提供了多样化的升学路径，保障学生毕业后的持续发展。最主要的升学途径是通过参加北京市高等职业教育招生考试，即通常所说的“职教高考”，考入各类本科院校或高职院校继续深造。
学生可以报考对口专业的本科或高职院校，例如北京联合大学、北京信息科技大学、北京工业职业技术学院等。学校会为有升学意愿的学生组织系统的文化课和专业技能课的复习辅导，助力其备考。
其次，学生可以通过“3+2”中高职衔接项目升学。学校与部分优质高职院校合作，开设中高职衔接班，学生完成前三年中职学习后，经考核合格可直接升入对接的高职院校就读后两年，毕业后获得大专学历。
此外，学生还可通过高职自主招生、技能大赛获奖免试升学等渠道进入高等院校。对于成绩优异、技能突出的学生，参加国家级或市级职业院校技能大赛并取得优异成绩，有机会获得免试进入本科或高职院校学习的资格。
