北京市昌平卫生学校为学生提供了多种升学路径，满足学生继续深造的需求。主要的升学途径包括参加北京市高等职业教育自主招生考试，学生可以通过该考试升入相关的高等职业院校，攻读大专学历。部分专业可能参与中高职贯通培养项目，即“3+2”模式，学生完成中职阶段学习并通过转段考试后，可直接升入对接的高职院校学习。
对于成绩优异的学生，学校会组织辅导，支持其参加普通高考或针对中职生的职教高考，冲刺本科或高职院校。此外，学生还可以通过成人高考、自学考试等非全日制形式，在工作之余提升学历。学校通常会与多所高等医学院校建立合作关系，为学生升学提供信息咨询和报考指导，帮助学生规划最适合自己的升学道路。
