重庆第三卫生学校的学生毕业后拥有多种升学路径可供选择，主要渠道包括高职分类考试招生和“三二分段制”中高职贯通培养。高职分类考试招生是针对中职毕业生升入高职院校的主要方式，学生通过参加文化素质测试和职业技能测试，可根据成绩报考重庆市内乃至全国的部分高等职业院校的专科专业，继续深造。
“三二分段制”是另一种重要途径，学校与特定高职院校联合办学，前三年在中职学校学习，经转段考核合格后，直接升入对接的高职院校对应专业再学习两年，毕业后获得全日制大专文凭。这条路径升学目标明确，衔接相对顺畅。
此外，成绩特别优异的学生还可以通过技能拔尖人才免试、参加普通高考等方式，争取升入本科院校学习的机会。学校通常会为有升学意愿的学生提供针对性的辅导和支持，帮助学生实现学历提升的梦想。
