玉溪农业学校为学生规划了多元化的升学路径，确保有继续深造意愿的学生能够顺利进入高等教育阶段。最主要的路径是参加云南省“三校生”高考，这是中等职业学校学生升入本科或专科院校的主要渠道，考试内容为“文化素质+职业技能”，学校会组织专项复习和辅导，帮助学生备考。
其次是高职院校单独招生，云南省内多所优质高职院校会面向中职毕业生开展单独招生，由院校自主组织考试，录取机会较大。第三条路径是“中高职贯通”培养，学校与部分高职院校合作开办“3+2”分段制培养专业，学生完成中职阶段学习后，通过考核可直接升入合作高职院校就读，无需再参加统一高考。
此外，学生还可通过成人高考、自学考试等非全日制形式边工作边提升学历。学校设有专门的升学指导部门，为学生提供政策解读、志愿填报、复习备考等全方位服务，助力学生实现大学梦想。近年来，通过以上途径成功升学的学生比例稳步提升。
