文山州卫生学校为学生提供了多样化的升学通道，助力学生提升学历层次。最主要的途径是参加云南省的“三校生”高考，即中等职业学校毕业生对口升学考试。学生可以通过该考试，报考省内外的医药卫生类高职专科院校，甚至本科院校，继续深造。
此外，学生还可以通过高职院校单独招生考试进入大学。许多高职院校会面向中职毕业生开展单独招生，考核方式相对灵活。学生在校期间也可以选择参加自学考试或成人高考，利用业余时间攻读大专或本科学历，实现学历提升。学校通常会为有升学意愿的学生提供相关的文化课和专业课辅导，支持学生实现大学梦。
