甘南州中等职业学校结合区域经济发展需求和民族地区特色，重点建设了一批优势明显、就业前景良好的专业。其中，畜牧兽医专业是学校的传统强项和品牌专业，该专业紧密依托甘南州作为重要畜牧业基地的产业背景，培养学生掌握现代畜牧养殖、动物疾病防治、饲料配制等实用技能，毕业生深受本地及周边牧区、养殖企业的欢迎。
护理专业也是学校的王牌专业之一。随着健康服务业的发展，基层医疗机构对护理人才的需求持续增长。学校该专业配备有基础护理、解剖等实训室，注重学生实践操作能力的培养，为学生考取护士执业资格证打下坚实基础。此外，学前教育专业面向幼儿园教师岗位培养人才，课程涵盖幼儿心理学、活动设计、音乐舞蹈美术技能等，因契合社会需求而备受关注。
旅游服务与管理专业则充分发挥了甘南州旅游资源丰富的优势，主要培养导游、酒店服务、景区管理等方面的技能人才。学生不仅学习旅游文化知识，还接受藏族歌舞、礼仪等特色培训，增强了在民族地区旅游行业就业的竞争力。汽车运用与维修、中餐烹饪等专业则面向广阔的技术服务市场，以扎实的实操教学见长，也是学校重点建设的技能型专业。
