安徽亳州新能源学校紧密围绕国家新能源产业发展战略和地方经济建设需求，设置了多个特色鲜明、实力突出的王牌专业。其中，新能源汽车运用与维修专业是学校的核心专业之一，该专业培养学生掌握新能源汽车的结构原理、检测维修、充电设施运维等前沿技术，对接快速发展的新能源汽车后市场服务领域。
光伏工程技术与应用专业同样是学校的重点专业，专注于太阳能光伏发电系统的设计、施工、运行与维护，为光伏电站、分布式光伏项目培养紧缺的技术技能人才。机电技术应用专业作为传统优势专业，融合了自动化、智能制造等新技术方向，培养学生成为机电设备安装、调试与维护的多面手。
此外，社会文化艺术专业（如学前教育方向）、计算机应用、电子商务等专业也颇具实力，形成了以新能源类专业为龙头，多学科协调发展的专业布局，能够满足学生多样化的学习和发展需求。
