郑州铁道中等专业学校的专业设置紧密围绕轨道交通和现代服务业，其王牌专业主要集中在铁道运输类和城市轨道交通类。例如，铁道运输管理专业是学校的传统优势专业，该专业培养学生掌握铁路行车组织、客运组织、货运组织等专业知识和技能，课程设置与铁路现场实际结合紧密，为学生进入国铁集团、地方铁路公司等企业打下坚实基础。
另一个王牌专业是城市轨道交通运营管理。随着我国城市地铁和轻轨的快速发展，该专业人才需求旺盛。学校该专业注重实践教学，培养学生具备站务管理、票务组织、行车调度、应急处理等核心能力，毕业生深受各地地铁公司的青睐。此外，电力机车运用与检修、铁道信号等专业也是学校的特色专业，这些专业技术性强，就业指向明确，是学校长期积累和重点建设的领域。
