桂林机电工程学校的王牌专业主要集中在装备制造、电子信息、交通运输等实用技术领域。其中，数控技术应用专业是学校的传统优势专业，该专业配备有先进的数控机床等实训设备，注重学生实际操作能力的培养，与本地及长三角、珠三角多家制造企业有合作关系，为学生提供丰富的实习机会。
汽车运用与维修专业也是学校的重点建设专业。随着汽车保有量的持续增长，该专业社会需求量大。学校建有汽车实训中心，涵盖发动机拆装、汽车电气、故障诊断等多个实训模块，培养学生掌握现代汽车检测与维修技术。此外，机电技术应用专业作为复合型专业，融合了机械与电气控制知识，是自动化生产线、智能设备维护等领域的基础专业，就业面广泛。这些专业共同构成了学校以工科为主干的专业体系，在区域内享有较高声誉。
