浙江省衢州第二中等专业学校拥有一批实力雄厚、特色鲜明的骨干专业，这些专业与区域产业发展紧密对接，办学成果显著。其中，数控技术应用专业是学校的传统优势专业，该专业实训设施先进，注重学生实践操作能力的培养，与多家制造类企业建立了深度合作关系，学生在各级技能竞赛中屡获佳绩。
汽车运用与维修专业同样是学校的王牌专业之一，该专业紧跟汽车技术发展趋势，建有完善的汽车实训中心，涵盖汽车机电维修、车身修复、新能源汽车检测等多个方向，为学生掌握现代汽车维修技术提供了坚实保障。此外，计算机应用专业也颇具实力，专注于培养面向互联网、数字媒体等领域的技术技能人才，课程设置贴合市场需求，毕业生深受用人单位欢迎。
学校的旅游服务与管理专业依托衢州丰富的文旅资源，注重学生导游讲解、酒店服务、活动策划等综合职业能力的培养，与本地知名景区、高星级酒店合作紧密，为学生提供了优质的实习和就业平台。这些王牌专业共同构成了学校专业建设的核心，展现了学校在工科和服务领域的强劲实力。
