安徽工程技术学校拥有一批实力雄厚、就业前景广阔的骨干专业，这些专业紧贴区域经济发展和产业需求。其中，机电技术应用是学校的传统优势专业，该专业培养学生掌握现代机电设备安装、调试、维护与管理等综合技能，实训设施完备，与多家制造类企业有深度合作。数控技术应用专业也是重点建设专业，侧重于数控加工工艺编制、数控编程与操作等高技能培养，学生多次在省级、国家级技能大赛中获奖。
建筑工程施工专业是学校的另一张王牌，涵盖建筑识图、测量、施工技术与组织管理等核心课程，为学生进入建筑行业打下坚实基础。汽车运用与维修专业则对接快速发展的汽车后市场，拥有先进的实训车间，培养学生汽车检测、故障诊断与维修能力。此外，计算机应用、会计等专业也颇具特色，注重实践操作与职业资格认证相结合，形成了文理兼修、工科见长的专业格局。
