株洲生物工程中等专业学校依托地方产业和自身办学积淀，开设了多个重点和特色专业。其中，生物化工技术应用是其传统优势专业，该专业紧密对接生物医药、食品加工等产业，培养学生掌握发酵技术、生物分离提取等核心技能，实训条件较为完备，毕业生在相关领域认可度较高。
机电技术应用专业也是学校的王牌专业之一，主要培养掌握机械制造、电气控制、设备维护等技术的技能人才。该专业实践性强，与本地装备制造企业有较多合作，为学生提供了良好的实习和就业平台。此外，计算机应用专业作为信息时代的通用技能专业，学校在办公自动化、网络技术、平面设计等方向均有培养，是备受学生欢迎的专业方向。
园林技术专业则结合了当地农业特色，培养学生园林规划、植物栽培与养护、花卉营销等能力，具有鲜明的涉农特色。这些专业均注重理论与实践相结合，配备了相应的实训基地，旨在培养市场急需的中等技术技能人才，构成了学校专业建设的骨干力量。
