北京交通学校作为一所专注于交通运输领域人才培养的职业院校，其王牌专业紧密围绕现代综合交通体系建设需求设置。城市轨道交通车辆运用与检修专业是学校的传统优势专业，主要培养具备城市轨道交通车辆驾驶、检测维护及故障处理能力的技能型人才，课程体系涵盖车辆构造、电气控制、运营管理等内容，实训设施先进，与多家地铁运营公司有深度合作。
新能源汽车检测与维修专业是顺应汽车产业变革而设立的重点专业，专注于培养掌握新能源汽车动力电池、电机电控等核心系统原理与维修技术的高素质技能人才。学校配备有现代化的新能源汽车实训中心，帮助学生掌握前沿技术。汽车运用与维修专业同样是骨干专业，历史悠久，培养体系成熟，侧重于传统汽车与智能网联汽车技术的维护与修理，学生多次在国家级技能大赛中获奖。
交通运营服务专业（或城市轨道交通运营管理）主要面向地铁、公交等客运企业的站务、调度、客运组织等岗位，培养服务与管理并重的复合型人才。此外，智能交通技术应用、物流服务与管理等专业也是学校着力建设的特色专业，这些专业共同构成了学校以“大交通”为背景的专业群，具有鲜明的行业特色和较强的就业竞争力。
