甘肃理工中等专业学校的王牌专业主要集中在与区域经济发展紧密结合的工科领域，特别是那些技术含量高、就业市场需求旺盛的专业。其中，机电技术应用是学校的传统优势专业，该专业培养学生掌握现代机电设备的操作、安装、调试与维护技能，实训设施完备，与多家制造类企业有合作关系。电气技术应用专业同样实力突出，侧重于工业电气控制、供配电技术等方向，毕业生在自动化行业很受欢迎。
汽车运用与维修专业也是学校的重点建设专业，配备了先进的汽车实训中心和检测设备，紧跟新能源汽车技术发展趋势，为学生提供扎实的汽车机修、电控系统检修等实用技能。此外，建筑工程施工、计算机应用等专业也以其扎实的教学和良好的就业口碑成为学校的强势专业。这些专业共同构成了学校以理工为特色的专业体系，在区域内享有较高的声誉。
