平阳县第二职业学校的专业设置紧密对接区域产业需求，形成了多个具有影响力和特色的王牌专业。其中，机电技术应用专业是学校的传统优势专业，该专业配备有先进的实训设备，注重学生实际操作能力的培养，与本地多家制造企业建立了深度合作关系，为学生提供了稳定的实习和就业平台。
电子商务专业是学校重点发展的新兴王牌专业。该专业紧跟数字经济发展趋势，课程涵盖网店运营、新媒体营销、直播电商、客户服务等领域，建有模拟电商运营的实训室，并积极组织学生参与各类电商实战项目，毕业生在本地电商产业中很受欢迎。
此外，计算机应用专业也是学校的强势专业之一，侧重于软件与信息服务、网络技术等方向的培养。学校通过项目化教学，让学生掌握扎实的编程基础和网络维护技能，该专业学生在各级技能竞赛中屡获佳绩，升学与就业前景广阔。这些王牌专业共同构成了学校人才培养的支柱，体现了其办学特色与实力。
