北京市海淀区卫生学校开设了多个具有特色和优势的专业，其中一些专业因其社会需求量大、就业前景好、办学历史悠久而被视为学校的王牌专业。护理专业是学校最传统和核心的专业之一，该专业培养学生掌握扎实的护理学理论知识和熟练的临床操作技能，毕业生是各级医疗机构迫切需求的人才。助产专业也是学校的重点专业，针对妇幼保健机构的特定需求，培养能够从事临床助产、母婴保健等工作的高素质技能型人才。
此外，医学检验技术专业是医学诊断领域的重要支撑，学校该专业培养学生掌握现代医学检验技能，就业面向医院检验科、疾控中心等，技术性强。药剂专业则面向医疗机构药房和医药企业，培养学生药品调剂、制剂、营销与管理的能力。康复技术专业随着健康服务业发展而日益重要，培养学生运用物理治疗、作业治疗等技术为患者进行康复服务的能力。这些专业均紧密对接北京市医疗卫生行业的需求，拥有完善的校内实训基地和稳定的校外实习医院，构成了学校专业建设的骨干力量。
