四川省水产学校作为一所专注于水产渔业教育的特色学校，其王牌专业主要围绕水产养殖、渔业资源与环境保护等领域展开。其中，水产养殖技术专业是学校历史最悠久、实力最雄厚的核心专业。该专业培养学生掌握现代水产养殖生产、管理、技术服务等方面的综合能力，课程涵盖鱼类增养殖技术、水产动物疾病防治、水产饲料与营养、水环境化学等核心内容，并与省内多家大型水产养殖企业建立了深度合作关系，为学生提供坚实的实践平台。
除此之外，学校的水族科学与技术专业也颇具特色，主要面向观赏水族产业，培养从事观赏水生生物繁育、养殖、水族馆设计与管理、水族器材营销等方面的人才。另一个重点专业是渔业资源与环境保护，该专业顺应国家生态文明建设需求，培养学生进行渔业资源调查评估、水域环境监测与保护、渔业生态修复等技能。这些专业均依托学校深厚的行业背景和实训资源，形成了理论与实践紧密结合的培养模式，毕业生在行业内认可度较高。
