张家港市第二职业高级中学开设了多个紧贴区域经济发展需求的专业，其中一些专业因其建设水平高、就业前景好而成为学校的王牌专业。学校的机电技术应用专业是传统的优势专业，该专业培养学生掌握现代机电设备的生产、安装、调试与维护等技能，实训设施完备，与本地多家制造业企业有深度合作。
数控技术应用专业也是学校的重点专业，侧重于培养数控加工编程、数控机床操作与维护的技术人才，该专业学生在各级技能大赛中屡获佳绩，毕业生深受装备制造类企业的欢迎。此外，计算机应用专业同样实力不俗，涵盖平面设计、网络技术、软件开发等多个方向，课程设置与时俱进，能够满足信息化社会对计算机技术人才的多样化需求。
电子技术应用专业则专注于培养电子产品装配、调试、检测与维修方面的技能型人才，对接张家港及周边地区发达的电子电器产业。这些王牌专业共同的特点是实践性强，校企合作深入，能够为学生提供扎实的技能训练和广阔的就业平台，是学生选择该校时重点考虑的方向。
