永嘉县第二职业学校根据区域经济发展需求和自身办学积淀，建设了数个备受认可的重点与特色专业。其中，数控技术应用专业是学校的传统优势专业，该专业实训设施完备，注重学生实践操作能力的培养，与本地制造业企业联系紧密，为学生提供了良好的技能学习平台。电子商务专业是学校重点发展的现代服务类专业，紧贴数字经济浪潮，课程涵盖网店运营、新媒体营销、客户服务等实用技能，培养学生成为适应线上商业发展的技术人才。
此外，学前教育（幼儿保育）专业也是学校的特色专业之一，该专业培养学生掌握幼儿教育、保育的基本知识和技能，注重艺术素养和教学实操能力的提升，毕业生在本地幼教领域有较高的认可度。汽车运用与维修专业则面向庞大的汽车后市场，配备有专业的实训车间，教授汽车检测、维修、保养等实用技术，就业渠道较为畅通。这些专业共同构成了学校的骨干专业群，体现了学校在工科技术类和现代服务类人才培养方面的实力。
