杭州财经职业学校的王牌专业主要集中在财经商贸和信息技术领域，这些专业办学历史悠久，实力突出，与社会需求紧密结合。会计事务专业是该校的传统优势与核心王牌专业，该专业注重学生账务处理、税务核算、财务管理等核心技能的培养，配备有模拟仿真实训室，课程设置与会计职业资格考试紧密衔接，毕业生专业基础扎实，深受用人单位认可。
金融事务专业也是学校的重点专业，主要面向银行、证券、保险等金融机构培养前台柜员、客户经理、理财顾问等一线服务人才。该专业教学强调理论与实践结合，常引入行业专家进行讲座，并组织学生参加各类金融技能竞赛。电子商务专业作为顺应数字经济发展而强化的王牌专业，专注于培养网络营销、网店运营、新媒体推广、客户服务等实用型人才，拥有配套的实训基地，学生在校期间即可参与真实或仿真的电商项目运营，积累宝贵经验。
