广西交通运输学校作为一所专注于交通运输领域人才培养的区属公办国家级重点中等职业学校，其王牌专业紧密围绕交通运输行业的核心需求设置。学校的道路与桥梁工程施工专业是传统的优势专业，该专业培养掌握道路、桥梁勘测、设计、施工、养护与管理等技能的技术人才，课程设置与行业标准对接，实训条件完善，毕业生在区内基础设施建设领域认可度高。
汽车运用与维修专业同样是学校的王牌之一，该专业配备有先进的汽车实训中心，涵盖汽车机电维修、车身修复、新能源汽车技术等多个方向，与多家汽车服务企业开展深度合作，注重学生实操能力的培养。此外，物流服务与管理专业也颇具实力，依托广西作为面向东盟国际大通道的区位优势，该专业聚焦现代物流、仓储配送、货运代理等领域，为学生进入快速发展的物流行业奠定坚实基础。
航海类专业是学校极具特色的王牌专业群，包括船舶驾驶、轮机管理等方向，实行准军事化管理，培养符合国际公约和国家船员适任标准的高素质航海人才，毕业生主要面向国内及东南亚航线航运企业，就业市场明确。这些专业共同构成了学校以“交通”为特色的专业体系，在区内中职教育中具有鲜明优势和较强竞争力。
