甘肃中医学校作为一所专注于中医药人才培养的中等职业学校，其王牌专业主要集中在中医药特色领域。其中，中医专业是学校的传统优势与核心专业，该专业注重中医基础理论、诊断学、中药学、方剂学等核心课程的教学，培养学生掌握中医临床基本技能，为从事中医医疗、预防、保健等工作奠定坚实基础。
中药专业同样是学校的王牌专业之一，该专业侧重于中药鉴定、中药炮制、中药调剂、中药制剂等实用技术的学习，学生能够系统掌握中药材的真伪鉴别、质量评估及加工制备技能，对接中药生产、经营、服务等产业链环节。针灸推拿专业也极具竞争力，教学内容涵盖经络腧穴学、针法灸法学、推拿手法学等，强调实践操作能力，毕业生在康复保健领域需求广泛。此外，结合现代健康服务业发展，中医康复技术、中医养生保健等专业也日益成为学校的特色重点专业，这些专业紧贴市场，培养技术技能型人才。
