北京市公共交通高级技工学校的王牌专业紧密围绕现代交通行业发展需求设立，其中城市轨道交通车辆运用与检修专业是学校的核心与特色专业。该专业主要培养掌握城市轨道交通列车驾驶、车辆检修、故障诊断与排除等技能的高素质技术技能人才，课程设置与北京地铁等企业的实际工作岗位要求高度对接，实训设备先进，毕业生深受用人单位青睐。
汽车维修专业同样是学校的传统优势专业，涵盖燃油车与新能源汽车的检测与维修技术。随着汽车产业电动化、智能化发展，学校在该专业方向持续加大投入，培养学生掌握前沿的汽车技术。此外，交通客运服务专业专注于培养城市公共交通运营管理、客运服务、站务管理等领域的服务与管理人才，契合北京大型交通枢纽及公交、地铁系统对高素质服务人员的巨大需求。这些专业均具有校企合作深入、就业定向性强、技能培养扎实的共同特点，是学校办学实力的集中体现。
