房山区第二职业高中的专业设置紧密围绕区域经济发展需求，其中一些专业因办学历史长、师资力量强、就业前景好而成为学校的王牌专业。学校的汽车运用与维修专业是传统优势专业，配备了先进的实训设备和车间，注重学生实操能力的培养，与多家汽车服务企业建立了合作关系。数控技术应用专业也是重点建设专业，面向现代制造业，培养学生掌握数控编程、加工与设备维护等核心技能。
此外，计算机应用专业和电子商务专业紧随数字经济发展步伐，课程涵盖平面设计、网络技术、网店运营、新媒体营销等内容，实训条件完善。学前教育专业则面向幼教行业，注重学生艺术素养与保教实操能力的双重培养。这些专业均构建了较为成熟的“校企合作、工学结合”人才培养模式，通过订单培养、顶岗实习等方式，有效提升了学生的职业竞争力，成为学生与家长青睐的选择。
